男性不育是一多发、难治性疾病。总体上看，目前临床治愈率不高，治疗难度较大，由于男性不育症的病因十分复杂，部分病因还未完全弄清楚，针对目前的具体病因治疗，其效果各异，总的看来效果不甚满意。对精子少、活动能力低下、精子畸形、精液量少者，用中医药治疗，部分病人可治愈而达到生育，而部分病人精液只得到改善，仍不能生育。对此类患者，不能急于求成，应在辨证施治的基础上，守法守方，假以时日，并定期复查精液质量。因为精子的生成周期较长，达90天以上，即使治疗有效，亦须数月方显其功。
对精索静脉曲张所致不育者，部分病人经治疗后可达到生育，但曲张程度达量度以上，且病程较长，睾丸已发生较严重损害者，单纯中医治疗难达生育目的。对此类患者，可在环切的基础上继续进行辨证施治，中西医结合，效果较好。
特发性男性不育症是最富挑战性的难题之一，中医治疗有苗头，但未能被证实在临床上应用有确切的疗效。对特发性少精证，可在辨证的基础上，试用益肾、填精、活血、清热解毒之法，有时可取得满意疗效。 对生殖系有解脲支原体感染所致不育，因中西医均缺乏有效疗法，被认为是治疗的难点之一。虽然大多数患者没有临床症状，但它属湿热之邪内扰精室，破坏精液内环境，影响精子的生成、成熟及存活，导致精于数量下降，精于活动率、活动力降低及畸形等异常改变。针对该病的病因病机，可先用清热、利湿、解毒之法，药如白花蛇舌草、虎杖、益母草等，有杀灭解腮支原体的作用。几年来的临床验证，证实其在治疗精液解脲文原体感染的同时改善了精液质量。免疫性不育亦是治疗的难点之一。目前的治疗效果都还不很理想，大剂量激素冲击疗法疗效有限，而且不良反应大。中药治疗本症表现出可喜的苗头。对此类患者，可在辨证的前提下，参用健脾固表法，方用玉屏风散加味(黄芪、白术、防风、生石膏、黄相等)，改善病人的过敏体质。经过一段时间的治疗，可抗精子抗体转阴。无精子症属男性不育症中的疑难重症，短期内难以获愈。其中，先天性输精管缺如、睾丸生精功能障碍等为不可逆的无精于症，治疗几乎无望。中药对生精干细胞的作用，目前尚缺少实验证据，各种可能的作用需要科学地探索。但是，中药所表现的对生精子细胞的诱导、促分化作用的现象和事实，值得引起重视，由此产生的研究思路令人振奋。如是阻塞性无精子症，有些可治，有些则难治，但近年随着显微外科的发展，又增加了治疗手段。另外，中医可拟以清热利湿、化瘀补肾的方法治疗。
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